Jep 能够帮上很大的忙，在控制菜单中可以将它与某些工具组合起来，然后就可以让Jep帮你去做你做不了的事情了。
再次来到风车处，风车一旁的树上有只大猴子将扇叶踩住，此时只能将Jep与得到的松果、葡萄、橙子或者椰子组合起来，然后让Jep去把这礼物送给大猴子，这样的话大猴子就会放开风车，此时就可以在风车上使用厚布(strong cloth)，修理好风车，但是此时风车仍然不能转动，于是我走进风车。在风车里我将Jep和海豹脂肪组合起来，让Jep拿着海豹脂肪爬上风车的转轴，将锈蚀的风车转轴重新打滑，现在风车终于开始转动了。现在就可以将原先得到的小麦放入磨盘中研磨面粉(flour)，此时还可以： 面粉 + 水 + 鸟蛋 (最初可以得到一个，后来也可以得到一个)+ 枫糖浆 + 柠檬 =未烘焙蛋糕(ready to bake cake)，如果把它放入火炉烘烤可以得到蛋糕(cake)。此后还可以将变硬了的火药(hardened powder)拿到风车处研磨成火药(powder)。
从风车出来，从修好的台阶下去，此时面前有一条长长的藤蔓，下来我让Jep拿上小刀也就是使用刀片与它组合，让Jep砍下藤蔓，得到两个绳梯(rope ladders)。
来到刚才不能经过的断桥前面，将Jep和绳梯组合起来，在两段之间搭起一座吊桥。吊桥搭好以后，我们走到桥的另外一边，可以看到前面就是一座火山，原来这就是为什么岛上总是发生不间断振动的原因。
拾起在温泉旁边的硫磺(sulfur)，此时转向另外一头，此时从一旁的破棚子中爬出一只拿着木棍的猴子，我们怎么能够在不伤害它的前提下赶走它呢？
这里有如下方法：
1.将长竹条放入温泉中会发生爆炸吓跑猴子
2.将刚才烤制的蛋糕给它，猴子会走开
3.在进入山顶洞穴后组合成蒸馏器可以将糖蒸馏成酒精(alcohol)，给猴子喝了就可以让它睡着了。
4.拣起一旁的破笼子(broken cage)，然后与柳条(wicker)组合得到笼子(cage)，这是可拆卸的物品，然后到温泉的蛇旁边将它抓进笼子，注意要先用树杈把蛇的脑袋插住，然后再将它抓进来，此后来到猴子面前把蛇放出来就可以了。
赶走猴子就可以拣起它身后的煤块(coal)，然后向前走到火山前，将身边的铁硫酸盐(iron sulfate)和碳酸钾(potash)拿到，现在我们就可以前往海滩了。
安葬尼摩船长：
来到海滩最初发现鸟巢下的沙滩上，让Jep带着绳梯爬上去搭起一座绳梯，终于我来到了尼摩船长的面前。
来到花冈岩房子里面 ，面前就是尼摩船长的尸体，这个纵横海底两万里的人物的最终归宿居然是这样。旋转视角，看到背后的石壁上有“花冈岩房子1860”的字样，拣起门口的鸟蛋(bird's egg)，并拣起散落在尼摩船长尸体旁的潜水服(diving suit), 音乐谱残卷(musical score)和神秘钥匙(mysterious key)，此外在尼摩船长的尸体旁边还可以见到一个滑车。
向前走去,此时左边与前面都由于太黑而看不清楚，于是向右边转去，在左边的支架上面得到厚木板(planks)，并且还可以得到铁沙(iron fillings)，螺丝起子(screwdriver)，铁槌(hammer)，钉子(nails)和线圈(roll of wire)。这时候可以组合铁槌+ 钉子 + 厚木板 =棺材(coffin)。旋转视角打开地上的箱子，从箱子中得到2件衬衫(shirts)和 3个灯芯(wicks)。向右转, 看到一门大炮，拿起一旁的炮弹(cannonball)和变硬了的火药(hardened powder),注意这些火药可以拿到风车处研磨成火药(powder)。 看了两边墙壁上的地图，了解到原来我在林肯岛上，并且知道了花冈岩房子如何被建造的。拿起下层支架上的相片(photo)，拿起桌子上的在地图下面的锌制试管器件(rods and tubes)。 在桌子的日记上可以读到尼摩船长的文字，但是现在这段文字是不完整的，右边被撕开少掉了一部份。上面写着：“我想要被埋葬……如果想要摧毁潜艇的守卫机器人，只有瞄准控制器……”而左边的日记告诉我们如何配置一些化学药品，稍后我将会用到。而现在就让我去完成尼摩船长最后的愿望。
来到入口处在尼摩船长的身体上使用棺材，将棺材按上滑轮，然后用滑轮将棺材放下，将尼摩船长的尸体安葬在海滩上，此时远处的石拱门处突然出现了尼摩船长的幻影，他大喊着 “给你一个礼物”，走过去得到了尼摩船长留下的礼物——大牡蛎，用刀将大牡蛎剖开，见到一颗巨大的黑色珍珠。
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