在进入游戏的开头画面时，玩家们看到的是有五个选项。当然不用说，第一个选项就是重新开始一个新的游戏“新游戏(ニュ－ゲ－ム”；而第二个就是继续玩取玩家们的记录进度“读取(ロ－ド”；第三个就是可以和友人对战的模式(2P对战)，只不过玩家们可是要记清楚自己编成的40张卡片的顺序编号才行，要不然会被看光的；第四个是可以交换玩家们之间的卡片的“交换卡片模式(トレ－ド”；而最后一个就是下载功能到小PS上(只有功能哦！)因爲它只有可以编成卡片、看卡片、换卡片和对战而已，所以笔者说它只有下载功能到小PS上而已。
第四项的交换卡片模式，会在后面的文章详细的爲玩家们做介绍。至于其他的选项就不多做介绍了。
主目录
当玩家进行记录进度游戏时，会碰到六个选项：第一个是继续游玩故事进度的“卡片中心(キャンベ－ン”。
第二个是可以和在故事内容中和所对战过的人物再进行“自由对战模式(フリ－デュエル”。在这里胜利的话，可以赚取卡片，当然这里的胜负不是那麽的重要(※只不过胜利后所得到的星星数很重要，因爲星星可以换到卡片)。
第三个是“卡片编成(デッキ编成)”，这边可以组合出属于自己的一副牌(※一副牌只能编成40张卡片)。
第四个是“卡片图书馆(カ－ド图书馆)”，在这可看到玩家们自己所拥有的卡片种类，和看到所融合出来的卡片(※但这不包含在拥有的卡片种类之中)，也可看到卡片内召唤兽的介绍与3D立体的模样。只要在选取到你所想看的卡片后，按下○钮，就会有卡片的介绍，再等到右下角的箭头出现，跟著按右就可看到召唤兽的形态和听到它的叫声了。
第五个选项是“密码(パスワ－ド”，这个是要在这里输入卡号(※也就是日本‘游戏王’里的真正卡牌左下角的编号)，只要正确的话，就会出现其编号的卡片，只不过玩家你要拿你在对战获胜时的星星来换，如果不够是不能换的，所以笔者才会说星星是很重要的，因爲有些卡片不是很容易就可以得的到的。但笔者不鼓励玩家再去花钱买这些卡片，或是输入密码(金手指)来得到这些卡片，要不然这个游戏还有什麽好玩的！！
最后一个选项是“记录(セ－ブ”。
详细解说
卡片编成
在这要和玩家介绍第三个选项的“卡片编成(デッキ编成)”。进入卡片编成后，玩家所看到的是卡片库(カバン内的卡片；而按右键所出现的是玩家们所编成游玩的40张卡片，如果要看卡片的内容的话就按△钮。在这里玩家可任意编成自己喜好或是拿手的牌［※只不过也要卡片库内有多的卡片(就是赢来的卡片)可以互换］。
爲什麽要和玩家介绍这个呢？因爲如果玩家进行“交换卡片(トレ－ド”的话，必须就要知道。因爲在交换卡片时，是在交换卡片库内的卡片，而不是编成在牌内的40张卡片；在和友人交换卡片时(靠记忆卡对记忆卡)一定要两个游戏者的名字都不同，相同的名字是不可以交换卡片的。交换完时，所交换的卡片会从各自所拥有的卡片库中消失，所以千万要有多余的卡片时再做交换。一副牌最多可编成三张同样的卡片，所以等你拥有超过3张卡片时再做交换，这样会比较好。而在交换卡片时，1次只能交换10卡，但不计次数。在每一次的交换，不管哪一方先选好，先选好的一方按□钮就好，后选好的一方要先按□钮，再按○钮就可以了，一直重覆就可以多换好几次了。
战斗
而在进行战斗时，分爲两种，一种是“平面的卡片战斗”；而另一种是可以看到召唤出3D立体召唤兽的“立体战斗”。这只要在战斗时，把□钮取代成○钮，也就是不按○钮，按□钮。当然也是可以在玩家选好要和对手战斗的卡片后(也就是最后要按的那一下)，按下□钮也可以。只不过因爲进入3D战斗需要一段时间…所以，建议玩家如果只是要看召唤兽的样子，那就到卡片图书馆、或是在战斗中遇到没见过的卡片时再进行3D战斗就好了。
在战斗中，如果是直摆的话，那就是以攻击力大小来决定胜负；而横摆就是以守备力来决定是否会被击破(※因爲横摆就不能发动攻击)。当然可以选择要亮出卡片或是盖上卡片。盖上卡片的话，敌人因爲看不见你出的卡片，所以不敢随便攻击你。
再来，如果遇到手中(台面上)是魔法卡或是强化、陷阱卡的话，而且也还派不上用场的话，但手上也没好的卡片，可以选择盖上牌，卡片就会自动选择到后排，等到派得上用场时再使用就可以了。
最后介绍如何用融合卡片，融合出更强的卡。只要把玩家想融合的卡按上，不管几张，只要按上(※别忘了选完了要按○钮)，这样就可以融合了。可以三张，也可以四张、五张一起融。
卡片的融合
本文结束前要介绍的是“卡片的融合”，而要融合卡片的话，就要看看卡片上的种族，所以在要进行融合时，不用去考虑到卡片的星星数或是守护星。虽然在融合时需要考虑到种族是否相合，但不是说只要是同种族就可以合出同一张卡片的，因爲卡片上也是有女性的，或是有别的属性，火啊、水啊、雷啊的什麽的一堆。所以看似简单，玩起来也不见得简单，但也不会说有
多麽的困难。在此就爲玩家介绍两张在初、中期就可以打遍天下无敌手的‘砂之魔女(砂の魔女：サンド ウイッチ’和‘双头雷龙(双头の雷龙：サンダ－ ドラゴン’，一个攻击力2100 守备力1700；另一个攻击力2800 守备力2100的这两张卡片。
【砂之魔女】
只要玩家在初期有女性类的卡片，不管它是战士一族、天使一族，还是魔法使一族或是植物的也好，不管是哪一个种族，反正它只要是女性的卡片就可以了。然后再跟岩石一族随便一张融合，然后就会出现这一张攻击力2100 守备力1700的‘砂之魔女’了。一有这张卡片，对手就会都把卡片横摆盖起来了。
【双头雷龙】
玩家只要拥有龙族、植物和雷族(有岩石族也可以)就可以了。但是你不是可以随便放、随便摆就可以融合出这一张击力2800 守备力2100的‘双头雷龙’的。首先融合的是龙和植物，哪张摆在前面都没关系［※这样就会出现一张攻击力2100 守备力1800的‘密林黑龙王(密林の黑? BR>王)’］，再来才是放雷的。当然你手上这3张卡片一起出现的话，也是可以来个3融合，但是一定要把雷的摆在最后面一张，而3融合的就一定要龙、植物(植物、龙)、雷这样才行。如果你不小心把顺序弄错了，合出一张攻击力1600 守备力1500的‘雷龙(サンダ－ ドラゴン’也没关系，你只要再合上一张龙族的卡片也是可以合出这一张‘双头雷龙’的。也就是说，可以先用雷族和龙族合出雷龙，再加上一张龙族，照样合的出来。3融合就要龙、雷(雷、龙)、龙这样才可以。而和岩石族的融合…那…先要拿龙族和岩石族合出一张攻击力2000 守备力2300的‘岩龙(スト－ン ドラゴン’，再来加上一张雷族的，这样也是可以合的出来‘双头雷龙’的啦！3融合也是只要把雷族的摆在最后一张就可以了。
当然融合的方法有很多种，看各人怎麽去合而已。好了，其他的就留著给玩家们自己去尝试其他卡片的融合方法了。只不过，教各位一个更方便的方法，不用在那边一直试一直试。在“自由对战模式(フリ－デュエル”中，最下方的左下角有一个决斗大师－K(デュエルマスタ－K)，玩家们只要跟他对战的话，就可以知道自己所拥有的卡片该如何融合了。因爲……他就是你(就是玩家你)，你不会的…他都会。怎麽样，够意思了吧！？可以省下不少的时间喔！
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