InterViewer蛋白质结构分析软件是生物信息工程中最基本也是最重要的数据之一 -,通常都需要使用专业的绘图工具InterViewer才能够处理。蛋白相互作用网络经常包括数千或更多节点的,这严重地限制了许多图表的绘图工具的实用性,因为他们成为网络的交互式anal- ysis太慢,因为它们产生混乱附图与许多边交叉。我们提出了一个新的,非常快速的布局算法及其实现,叫做InterViewer3可视化大规模的蛋白质相互作用网络。
使用方法
(1)首先找到整个网络的连接的部件的布局,
(2)发现与所连接的组件中相对于枢轴节点的节点的全球布局,
(3)细化每个被连接成分的由第一重新定位的本地布局midnodes就其cutvertices和cutvertices的直接邻国,然后通过重新定位的所有节点相对于他们的邻居在距离2的优势
图形绘制方法:
(1)这是一个数量级的速度更快,
(2 )它可以直接可视化从蛋白质相互作用数据库中的数据
(3)它提供了几个操作为有效探索大规模蛋白相互作用网络。